Гнійні рани, інфіковані опіки, бактеріальні та грибкові захворювання шкіри та слизових оболонок, у т. ч. у стоматології (полоскання та зрошення – гінгівіт, стоматит, афти, пародонтит, альвеоліт), хірургії, урології, акушерстві-гінекології.
Лікарський засіб застосовується у вигляді зрошень, полоскань та аплікацій – 5-10 мл розчину наносять на уражену поверхню шкіри або слизових оболонок з експозицією 1-3 хв 2-3 рази на добу (на тампоні або шляхом зрошення).
Перекис водню одностайно визнається лікарями як найкращий антисептичний засіб. Вона безбарвна, не обпалює рану, не дратує шкіру та годиться для промивання ран. Щоправда, існує думка, що рани, оброблені перекисом гояться повільніше. Розчин хлоргексидину хороший тим, що не має кольору та запаху.