З обережністю призначають материнку чоловікамоскільки рослина містить фітоестрогени і знижує вироблення тестостерону.
Материнку та напої на її основі не рекомендується вживати дітям до 3 років. Лікарі не радять пити відвар з материнки під час вагітності. Захворювання серцево-судинної системи, ниркова недостатність (без попередньої консультації лікаря).
Материнку використовують при атонії кишечника (підсилює перистальтику), спазмах в ділянці шлунка, гастритах, запаленні печінки, жовтяниці, безсонні, нервових розладах, кашлюку, а також як відхаркувальний засіб.