Під дією антибіотиків організм втрачає здатність самостійно протистояти різним інфекціям. І крім того, їх широке застосування призвело до того, що стало причиною появи штамів бактерій, стійких до цих препаратів. Адже зараз лікарі призначають такі препарати на пік вірусних захворювань.
Проте разом із патогенними мікроорганізмами антибактеріальні засоби знищують корисні біфідобактерії та лактобактерії в організмі. Від цього засмучується травлення, знижується вироблення вітамінів групи В, К, фолієвої та нікотинової кислот, порушується синтез амінокислот, слабшає імунітет.
Підсумовуючи можна відзначити, що антибіотики надають пряме вплив на хвороботворні мікроорганізми на організм вони можуть надавати вплив як прояви характерних побічних ефектів, таких як: алергічні реакції; розлад шлунка внаслідок дисбактеріозу (порушення балансу мікрофлори в кишечнику);
Вживання антибіотиків без необхідності може викликати алергічні реакції, зміни в мікрофлорі кишечника, біль у животі та пронос. При вживанні неефективних проти збудників антибіотиків може розвинутись резистентність бактерій, іншими словами, стійкість до антибіотикам.