Борець джунгарська був включений до VIII Державної фармакопеї СРСР (1946). В даний час цей аконіт використовується лише у народній медицині. Настоянку кореневищ використовують зовнішньо при невралгіях, мігрені як болезаспокійливе. У гомеопатії застосовують від головного болю.
Аконіт глибоко проникає в будь-які тканини, добре знищує метастази, бореться з пухлиною, знімає спазми, заспокоює, дає сильний протизапальний та знеболюючий ефект. Практично єдиний засіб проти саркоми, меланоми, плоскоклітинного раку, лейкозу та лімфогранулематозу.
Приймати настоянку аконіта слід 3 десь у день 30 хвилин до їжі на 50-100 мл води. Т. е. перший день потрібно пити по 1 краплі 3 десь у день, другий день по 2 краплі 3 десь у день і т.д.