Велика кількість стовбурових клітин одержують із пуповинної крові. Беруть кров із пупкової вени дитини. Отриманий біоматеріал зберігається у спеціальному банку. Зберегти стовбурові клітини виходить при використанні рідкого азоту.
Вони містяться як у пуповинній крові, так і в кістковому мозку – саме їх часто використовують для трансплантації при злоякісних захворюваннях крові.
Трансплантація стовбурових клітин передбачає паркан стовбурових клітин з кісткового мозку чи кровотоку донора. Більшість стовбурових клітин в організмі міститься у кістковому мозку (м'якій тканині у внутрішній порожнині кісток).